Часть 1 - ctOS Chicago
Здесь описываются дополнения к каноническим событиям



В то время пока Агенты Машины в Нью-Йорке, прячутся под новыми именами и личностями, Самаритянин, начинает разработку ctOS - Операционную систему управления городами. Под предлогом безопасности и удобства, в город Чикаго внедряется система, способная управлять буквально всем - светофоры, газораспределительные станции, мобильная связь - все оказывается в подчинении компьютера.
Самаритянин получил доступ ко всему - данные серверов и компьютеров, мобильная переписка, камеры переносных устройств - и самое главное - люди сами дают разрешение на доступ, устанавливая на свои устройства ctOS.
Подрядчиком выступает дочерняя для корпорации Decima Technologies корпорация Blume.
План проходит без изьянов - Мэром Чикаго становится Донован, который даст ctOS еще полномочий.

Часть 2 - Хакеры DedSec и Эйдан Пирс
Здесь описываются дополнения к каноническим событиям

На ctOS начинается ряд хакерских атак - с целью получить доступ к сети, для тех или иных целей. Из общего числа хакеров больше всего выделяется Эйдан Пирс и группировка хакеров DedSec. Blume нанимает ряд устранителей, для того чтобы вычислить и найти людей угрожающих вскрыть всю информацию об изначальных целях ctOS что может вывести на Самаритянина.

Не смотря на все потуги корпорации по защите системы, заручившись поддержкой Клары Лилл, хакерши из DedSec и Рэймонда Кини, создателя части кода ctOS - Эйден Пирс получает почти полный контроль над системой, но в виду того что он занят личной вендеттой - поиском заказчиков убийства своей племянницы Лены Пирс, он не ищет дополнительную информацию. Не смотря на то что он отказывается поделиться доступом с DedSec, организация все же находит и публикует часть информации, которая помогает сместить Мэра Донована, со своего поста.
Казалось бы, что проект ctOS на грани провала.

Часть 3 - ctOS 2.0
Здесь описываются дополнения к каноническим событиям

Не смотря на весь урон нанесенный проекту, Самаритянин продолжает внедрять ctOS по всей Америке, преследуя свою цель - тотальный контроль над человечеством. Быстрое расширение сети, позволило DedSec получить больше информации - а именно узнать что всей системой управляет Искусственный Интеллект.
Все кто получает эти данные - становятся второй угрозой для Самаритянина - все кто не умеет достаточно хорошо прятаться, или не достаточно хорошо заметает следы устраняется Агентами Десима Текнолоджиз.
Клара Лилл, хакер из DedSec обращается за помощью к Эйдану Пирсу, в поиске кто стоит за смертями большинства хакеров. Именно таким образом ячейка Пирса, становиться чуть ли не единственными кто обладает доступом к ctOS 2.0 и знающими что за всем этим стоит ИИ Самаритянин. На них объявлена охота.

Часть 4 - Machine Agents
Здесь описываются дополнения к каноническим событиям

В это же время Машина получает сообщение об объявлении войны со стороны Самаритянина. Получив номер - Клары Лилл, машина одновременно узнает о том что с помощью ее может получить доступ к ctOS, тем самым обезопасив Гарольда Финча, и дать команде дополнительные возможности.
Рут и другие Агенты приступают к поиску Клары, защищаемой Пирсом и Кинни.

И теперь вопрос остается только в том чем это все закончиться - завербует ли Машина новых агентов, умеющих успешно обходить защиту ctOS, или команды разойдутся после того как каждый получит что хочет? А возможно у них нет шансов против продолжающего усиляться Самаритянина?